La villa histórica de Betancuria era la antigua capital administrativa de Fuerteventura y fue reconocida como Bien de Interés Cultural, en calidad de Conjunto Histórico, en 1979. Entre sus pintorescas calles, se erige este museo fundamental para descubrir la historia de los aborígenes de la isla, los Mahos. En los yacimientos de La Pared, Cueva de Villaverde, Montaña de Tindaya, La Atalayita o La Fortaleza, entre otros, se hallaron restos arqueológicos hasta el siglo XV. Todo ese patrimonio queda recopilado en distintas exposiciones temporales como, por ejemplo, el resultado de las excavaciones ejecutadas en el área conventual del pueblo.